Resistance 3 นั้นเป็นเรื่องราวหลังจากภาคที่แล้วเป็นเวลา 4 ปี ซึ่งตัวเอกในภาคนี้ได้แก่ Joseph Capelli ที่เป็นพระรองในภาคที่แล้ว โดยที่ Joseph Capelli นั้น ได้อยู่ในที่หลบซ่อนแห่งหนึ่งใน Oklahoma กับผู้รอดชีวิตจากการรุกรานของเหล่า Chimera Joseph Capelli ได้แต่งงานกับ Susan Farley น้องบุญธรรมของ Nathan Hale ตัวละครเอกในภาคก่อน   บทบาทหลักของ  Joseph Capelli นั้นคือหยุดยั้งเหล่า Chimera ที่ขยายวงและพร้อมที่จะยึดโลกในอีกไม่ช้า โดยการไปทำลาย Chimeran Tower เพื่อหยุดยั้ง wormhole ที่จะนำพาเหล่า Chimera มายังโลก